对y2h系统进行操纵后
来源:    发布时间: 2018-07-14 17:12    次浏览   >

在广泛使用的酵母双杂交(y2h)方法中,携带一个“诱饵”蛋白的酵母细胞与携带一个“猎物”蛋白的酵母细胞配对。对y2h系统进行操纵后,只有“诱饵”与“猎物”蛋白黏在一起的细胞才能存活,从而使科学家可以观察到哪些蛋白间互相关联。在被命名为“条形码融合遗传学—酵母双杂交(bfg-y2h)”的新技术中,携带着数千“诱饵”和“猎物”蛋白的细胞在同一培养皿中配对。

据最新一期《分子系统生物学》报道,加拿大研究人员开发出一种新技术,可将dna(脱氧核糖核酸)条形码拼接在单个细胞内,以同时搜索数以百万计蛋白质对之间的相互作用。

然而,可在同一试管内进行的试验次数,却受限于编码的细胞类型数量。一直以来,dna条形码都是一维的,也就是一个条形码只能做一次试验。允许条形码在细胞内融合在一起,意味着科学家们现在可以打破这一障碍。新技术可显著提高在单一试管内进行的实验次数,在同等成本条件下能将效率提高10倍。

bfg-y2h方法的新颖之处在于,通过对细胞编程,将来自“诱饵”和“猎物”细胞的dna条形码连接在一起,形成一个“融合条形码”,然后利用新一代dna测序方法对融合条形码进行检测。

研究人员称,这项研究的最终目标,是建立蛋白相互作用网络的三维视图,而不是静态图。通过有效建立含有更丰富信息的蛋白相互作用图谱,bfg-y2h方法可拓展研究人员对细胞工作机理的理解,并展现只在某种特定环境条件下才能发生的蛋白相互作用,从而加速对基因功能和人类疾病的理解。

近年来,dna条形码技术使科学家开展高并行试验(许多不同类型的细胞在同一试管内进行试验)成为可能,而新一代dna测序技术的发展,进一步提高了对条形码计数和读取结果的效率。